Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms