Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms