Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms