Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chsy1Q6ZQ11 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms