Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms