Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LcorQ6ZPI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LcorQ6ZPI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms