Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms