Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms