Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc154Q6RUT8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms