Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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