Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms