Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff1Q6PFE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms