Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msl1Q6PDM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms