Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RgmaQ6PCX7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RgmaQ6PCX7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms