Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Herc4Q6PAV2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms