Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsen2Q6P7W5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsen2Q6P7W5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms