Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms