Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik3Q6P4S6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms