Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slx4Q6P1D7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms