Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1Q6NXH3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpbp1Q6NXH3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms