Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms