Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms