Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms