Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KdsrQ6GV12 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms