Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms