Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep290Q6A078 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Cep290Q6A078 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Cep290Q6A078 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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