Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn4Q69Z26 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms