Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms