Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn2aQ64364 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2aQ64364 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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