Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms