Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms