Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga3Q62470 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms