Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms