Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20865Q62460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20865Q62460 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms