Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nptx1Q62443 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms