Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms