Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spock1Q62288 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms