Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms