Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SypQ62277 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SypQ62277 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SypQ62277 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SypQ62277 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SypQ62277 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SypQ62277 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms