Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms