Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm5dQ62240 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms