Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb1i1Q62219 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb1i1Q62219 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms