Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtafrQ62035 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms