Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx5Q61686 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms