Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes3Q61657 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms