Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne1Q61457 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms