Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcolceQ61398 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PcolceQ61398 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PcolceQ61398 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms