Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrkQ60976 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms