Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms