Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1h2Q60644 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr1h2Q60644 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms